常用力场函数和分类

常用力场函数和分类_分子医学导论

    二、常用力场函数和分类

    按不同的分子力场选取不同的函数形式来描述上述能量与体系构型之间的关系。许多实验室设计了多种适用于不同体系的力场函数，根据选择的函数和力场参数，可以分为以下几类。

    （一）传统力场

    1．AMBER力场　是目前使用比较广泛的一种力场，适合处理生物大分子。

    2．CHARMM力场　对小分子体系到溶剂化的大分子体系都有很好的拟合。

    3．CVFF力场　可以用于无机体系计算的力场。

    4．MMX力场　包括MM2和MM3，是目前应用最为广泛的一种力场，主要针对有机小分子。

    （二）第2代力场

    第2代的势能函数形式比传统力场更加复杂，涉及的力场参数更多，计算量也更大，当然也相应地更加准确。

    1．CFF力场　是一个力场家族，包括CFF91、PCFF、CFF95等，可以进行从有机小分子、生物大分子到分子筛等诸多体系的计算。

    2．COMPASS力场　进行高分子体系的计算。

    3．MMF94力场　是目前最准确的力场之一。

    （三）通用力场

    通用力场也叫基于规则的力场，所用力场参数是基于原子性质计算而成，可以通过自主设定一系列分子作为训练集来生成合用的力场参数。

    1．ESFF力场　用于有机、无机分子的计算。

    2．UFF力场用　于计算周期表上所有元素的参数。

    3．Dreiding力场　适用于有机小分子、大分子、主族元素的计算。