实验五 酵母RNA的分离与鉴定
【实验目的】
1.了解并掌握稀碱法提取RNA的基本原理及具体方法。
2.了解RNA的化学组成及定性鉴定的原理与操作过程。
【实验原理】
由于RNA的来源和种类很多,因而提取方法各异,一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法是实验室最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被苯酚饱和的水相中。DNA和蛋白质则留在酚层中。向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好地除去DNA及蛋白质,提取的RNA具有生物活性。
工业上制备RNA多选用成本低,适于大规模操作的稀碱法及浓盐法。用发酵工业的下脚料如酵母、白地霉如青霉菌菌丝体等提取RNA,其得率常为菌种重量的3%~5%。而DNA含量仅为0.03%~0.52%,因此提取RNA多以酵母为原料。稀碱法是用氢氧化钠溶液,使细菌细胞壁变性,浓盐法是用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞壁的通透性,使核酸从细胞内释放出来。用稀碱使酵母细胞裂解后,用酸中和,然后除去菌体,用乙醇沉淀上清液中的RNA或将pH值调至RNA的等电点(pH2.5),使蛋白质沉淀出来。
RNA是生物高分子化合物,进一步水解可生成磷酸、戊糖和碱基。各种组分可用下述方法鉴定:
1.磷酸与钼酸铵试剂作用能产生黄色的磷钼酸铵[(NH4)3PO4·12MoO3]沉淀。
2.核糖与地衣酚试剂反应呈鲜绿色。
3.嘌呤碱与硝酸银产生白色的嘌呤银化合物沉淀。
【实验器材】
离心机、布氏漏斗、抽滤瓶、石蕊试纸、漏斗、表面皿。
【药品试剂】
1.干酵母粉。
2.0.2%氢氧化钠溶液。
3.乙酸、乙醚、95%乙醇、1 mol/L氨水、10%硫酸。
4.0.1 mol/L硝酸银溶液。
5.钼酸铵试剂:将2 g钼酸铵溶解在100 ml 10%硫酸中。
6.地衣酚试剂:100 ml浓盐酸中加入100 mg三氯化铁,摇匀,储存备用。使用前加入476 mg地衣酚(甲基苯二酚)。
【实验方法】
1.酵母RNA提取:
(1)称4 g干酵母粉置于100 ml烧杯中,加入40 ml 0.2%氢氧化钠溶液,沸水浴上加热30分钟,不断搅拌。
(2)加入数滴乙酸溶液使提取液呈酸性(石蕊试纸检查),4000 r/min,离心10~15分钟。
(3)取上清液,加入30 ml 95%乙醇洗2次,每次用10 ml。
(4)用无水乙醚洗两次,每次10 ml,洗涤时可用小玻棒小心搅动沉淀。
(5)用布氏漏斗抽滤,沉淀在空气中干燥。
(6)称量所得RNA样品重量,计量得率:
2.RNA组分鉴定:
(1)水解RNA:向锥形瓶中加入少量(0.1~0.2 g)酵母RNA和10%硫酸溶液15 ml。在瓶口上插一玻璃小漏斗,漏斗上盖上表面皿,然后在沸水浴中加热水解约30分钟,过滤,取滤液进行下列试验。
(2)嘌呤碱基的检查:取试管一支,加入1 ml 0.1 mol/L硝酸银溶液,再逐滴加1 mol/L氨水至沉淀消失。然后加入1 ml滤液,放置片刻,观察有无嘌呤碱基的银化合物沉淀产生(沉淀见光变为红棕色)。
(3)磷酸的检查:取2 ml滤液放入1支试管中,加入5滴硝酸银和1 ml钼酸铵溶液后,在沸水中加热,观察有无黄色磷钼酸铵沉淀产生。
(4)戊糖的检查:取一支试管,加入1 ml滤液,然后加入2 ml地衣酚试剂,摇匀后在沸水浴上加热10~15分钟,观察颜色的变化。
【注意事项】
1.稀碱法提取的RNA为变性RNA,可用于RNA组分鉴定及单核苷酸制备,不能作为RNA生物活性实验材料。
2.脱氧核糖及核糖均可与地衣酚反应。因此地衣酚试验不能作为RNA与DNA鉴别的依据。
【思考题】
1.在酵母RNA的提取实验中,95%乙醇有什么作用?
2.若要鉴定DNA水解液的组分,应如何安排试验?
3.现有三瓶未知溶液,已知它们分别为蛋白质、糖和RNA,采用什么试剂和方法对这三种溶液进行鉴定(自行设计简便的实验)?
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